As auditorias do SGI do CISI são realizadas para verificar o atendimento do SGI aos requisitos das normas que pertencem ao escopo e a eficácia de sua implementação.

Os programas de auditoria são elaborados com base na situação atual de cada processo, na sua importância, e nos resultados obtidos em auditorias anteriores. As auditorias internas e de Self-Audit são conduzidas por equipe qualificada, independente do responsável pela área auditada e pela equipe de auditores internos coordenada por um auditor líder cadastrado na Assessoria de Qualidade da COPPE.

Ao longo do mês de maio de 2011 o CISI passou por uma auditoria interna e uma auditoria de Self-Audit. O CISI foi classificado na categoria Prata 2, e a equipe auditora contabilizou o total de 20 não conformidades no SGI. O certificado foi entregue ao setor no evento comemorativo de seus 18 anos.